В городе Пустошка имеется железнодорожный вокзал. Режим работы: круглосуточно. От Пустошки по железнодорожному пути можно доехать до Пскова и Великих Лук, а также до городов Центральной России и Черноморского побережья. Часть рейсов начинает функционировать только во время курортного периода, поэтому весь список маршрутов необходимо уточнять в справочном центре вокзала, как онлайн, так и с помощью справочной телефонной службы.
Ж/д вокзал расположен севернее здания автовокзала, которое находится на этой же площади, с южной стороны. В городской части города около станции «Пустошка» находится краеведческий музей. Кроме этого, в ста метрах от станции находится крупный продуктовый супермаркет, в котором есть банкомат и терминал оплаты. Всю необходимую инфраструктуру турист могут найти около вокзала, на улице Советская. Здесь же находится несколько объектов туристической направленности, том числе гостиница. Из любого района города до автовокзала можно добраться на пригородном автобусе. Максимальное время составит двадцать пять минут, если добираться из пригородной зоны города, в том числе туристических баз.
