Так как станция метро Владыкино находится под железнодорожными путями, ее конструкция усилена дополнительным числом квадратных колонн, стоящих в два ряда на платформе. Их всего сорок штук. Колонны отделаны белым мрамором, полы на платформе сделаны из темного гранита. В отделке стен станции использовался гофрированный металл со вставками из темного мрамора, на которых расположены медальоны с изображением различных храмовых сооружений. Там присутствуют изображения храмов Японии, Индии, Венеции и Грузии. Также изображены: часовня архангела Михаила в Кижах, владимирские Золотые ворота и храм Рождества Богородицы, находящийся рядом со станцией метро Владыкино. Автор художественного оформления станции Владыкино - Мосийчук А. М.
Выйдя в город с северной стороны платформы, вы попадете на Алтуфьевское шоссе и Сигнальный проезд. Южный выход ведет к Сусоколовскому шоссе и улице Ботаническая. Вестибюли начинают свою работу с пяти часов двадцати минут утра и закрываются в час ночи. Вход и выход с платформы в обоих вестибюлях оборудованы эскалаторами. Между станциями Владыкино и Отрадное находится депо "Владыкино", введенное в строй в марте 1991 года. Оно обслуживает Серпуховско-Тимирязевскую линию метро. Депо оборудовано отстойно-ремонтными путями и специальным путем для мойки составов.
К станции Владыкино от депо ведут две однопутные служебно-соединительные ветви. Возле станции метро Владыкино находится главный вход в Ботанический сад Российской Академии наук, в котором представлены семь экспозиций самых разнообразных растений со всего мира, со всех климатических зон Земли.
Те, кто приехал в Москву по делам, найдут рядом со станцией Владыкино гостиницу "Восток". А любители кинематографии по достоинству оценят расположенный рядом кинотеатр. Также рядом с выходами из метро находятся остановки общественного транспорта, на котором можно продолжить свое путешествие по столице.