Названием станция обязана селу Рыбацкое, которое раньше находилось на этой территории. В 1715 году в эту местность переселили несколько сотен крестьянских семей, которые должны были ловить рыбу и поставлять ее к царскому двору, именно поэтому село получило такое название. Так как станция конечная, она имеет путевое развитием - перекрестный съезд для оборота поездов, за станцией находится электродепо.
Выходы со станции возможны к Тепловозной улице, 3-ему Рыбацкому проезду, железодорожной станции и остановкам наземного общественного транспорта. На станции расположены островная и две боковые платформы. Первая не действует, на нее ведет подземный переход. Боковые соединяются друг с другом пешеходным надземным мостом.
Строительство станции началось в период прокладывания дороги Вятка – Вологда – Петербург в 1901 году, однако станция метро «Рыбацкое» была открыта только в 1984 году. Чтобы повысить необходимую грузоподъемность, в 2001 – 2005 годах на станции полностью заменили железнодорожные пути все объекты инженерной инфраструктуры. В 2006 году произошло открытие нового пешеходного моста, в 2009 году удалось построить вокзальный многофункциональный комплекс.
Перегон, расположенный на станции, следует до «Купчинской, он представляет собой однопутную конструкцию, а до станции Обухово и Инжоры следует четырехпутный. Еще один однопутный перегон раньше соединял «Рыбацкое» и «Славянку, но в последнее время он используется только как подъездной путь. Помимо этого, на станции располагаются три подъездных пути, которые ведут к промышленным предприятиям и электродепо «Невское».
Всего в состав станции входит 23 подъездный пути, 5 их которых приемо-отправочные, а 4 – главные, остальные предназначен для маневровой работы. Станция «Рыбацкое» - это стык нескольких диспетчерских участков, также именно на ней происходит обслуживание маневровых тепловозов и собственных локомотивов. Тепловоз, который приписан к этой станции, также обслуживает «Ижоры».